来源：小桔灯网
作者：班木芙兰
路漫漫其修远兮，吾将上下而求索。
偌大的体外诊断世界，有微光学院就够了。
人类与新冠病毒的赛跑，也是与旧制度、旧规则的抗衡
年初，百年不遇的一次疫情被我们这代人赶上了，一时间全民奔赴在抗”疫“一线的战场上。正如张文宏医生所感叹的那样，中国控制疫情的速度在医学史上不曾发生过。
是啊，抗击新冠病毒的奇迹难道不就是来源于：政府高效管控、全民主动配合、医护无畏支持、企业忍痛合作、信息能力呈现为一体的救援大作战吗！
除此之外，在全球被新冠状病毒席卷的每一天里，一些看似冰冷的”机器"正在大众看不见的地方默默运行，它们是基因测序仪、PCR分析仪、呼吸机、监护仪等设备，它们正在通过不同的方式在抗“疫”中与救命的时间赛跑！
精准诊疗与前沿技术对病毒非常重要
01
疫情之下其全球医疗机构正在经受前所未有的考验，而对于突发新型病毒的诊断技术也成为重中之重。自新冠病毒爆发以来，相关科研机构紧锣密鼓地开展病毒研究工作，并取得了一系列重要研究成果。
值得注意的是，这些研究成果对全球新冠疫情的防控起到了极其重要的作用，关乎于对病毒的确诊、流行病的检测和调查、疫苗的研发等重要领域。
重大突破
2月3日，全球顶尖科学杂志《Nature》在线发布了复旦大学张永振教授团队的一项重要研究成果，该团队对患者支气管肺泡灌洗液进行了宏基因组二代测序（mNGS），鉴定出了一种新型冠状病毒，并发现该病毒基因组与蝙蝠体内发现的SARS样冠状病毒基因组有89.1%的相似性。
由此可见，在此次全球肆虐的新冠疫情中宏基因组测序在对新病原体的诊断、检测、跟踪，以及溯源方面发挥了的关键作用！
什么是宏基因组二代测序？
这里面涉及到两个概念。一个是宏基因组，另外一个是二代测序。宏基因组学（Metagenomics）的概念最初由JoHandelsman提出，其研究对象是样品中的微生物群体基因组，通过测序和功能基因筛查来分析和研究微生物的种群结构、进化以及与环境之间的互作。在描述基因组时，经常用到下面这张图。
（图片来源：网络）
有基因组之前是钓鱼，有基因组之后是网鱼。基因组学家们先把鱼捞出来，生化学家们再去研究功能。宏基因组也是一样，我们不用再去分离病原微生物，只需要将其DNA测出来，我们就知道这里面有啥致病菌了。
传统的Sanger测序手段通量太小，不适合宏基因组。因此，二代测序（nextgenerationsequencing）技术的诞生才极大地推动了宏基因组的发展。NGS特点是通量高、单位碱基价格便宜而且准确率高。
临床大咖与技术大咖的思想碰撞！
02
肺部感染精准治疗经典案例分享
去人源技术的mNGS平台战疫情
早前，医院曾出现一例令人疑惑的病例：患者女性51岁入院前进行门诊健康体检，查胸部CT示右肺多发结节，为进一步诊治收入院。
患者病程中无发热、无咳嗽、胸闷、胸疼等不适。既往史左乳腺癌根治术，术后进行放化疗，予他莫昔芬免疫治疗。
当时临床医生对该患者的初步诊断猜测有两种可能性：
非感染性疾病：乳腺癌肺部转移
符号列表感染性疾病：某种病原体侵入
为进一步确诊发病原因，医生经过患者同意支气管镜检查行BALF病原体高通量测序后发现新生隐球菌：reads
最后，经医生询问发现，该患者小区中饲养了较多鸽子，鸽子粪便中含大量肌酐的胍类，是支持新型隐球菌生长的重要营养物质，干燥鸽粪形成的气溶胶颗粒的直径＜2μm，易到达肺泡。
通过这一病例，可以发现二代测序技术在感染病诊断上具有重要的应用价值，对新发的、疑难的感染病能够指明方向，进而帮助临床进行判断。
鉴于此，作为在新冠肺炎诊疗过程中发挥举足轻重作用的呼吸科与体外诊断两大重点领域，微光学医院施毅教授，杰毅生物CEO王珺博士为大家带来一场别开生面的在线直播课程。
医院施毅教授将为我们带来《肺部感染治疗从经验到精准》
杰毅生物CEO王珺博士将为我们带来《去人源技术在呼吸道mNGSM检测中的应用》
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